本文標(biāo)題："菌群中鑒別微生物-培養(yǎng)的細(xì)胞檢測顯微鏡"
發(fā)布者：yiyi ------ 分類: 行業(yè)動(dòng)態(tài) ------
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菌群中鑒別微生物-培養(yǎng)的細(xì)胞檢測顯微鏡
被鑒定為屬于未培養(yǎng)的古生菌，如ANME一2。這些菌周圍是硫酸鹽
還原菌群。這些工作為生物代謝中甲烷氧化提供了有力證據(jù)。雖然13c
標(biāo)記參與甲烷氧化是可以斷定的并且靠SIMS分析已經(jīng)得到解釋，但不利
用加入標(biāo)記的培養(yǎng)基其他形式的C代謝可能更難說明。利用熒光標(biāo)記的
寡核苷酸探針來研究細(xì)胞固定或雜交需要考慮外加碳源的同位素干擾。
單細(xì)胞同位素標(biāo)記技術(shù)主要局限是它們只能提供可標(biāo)記或可同位素
示蹤的培養(yǎng)基代謝信息。這不利于我們對整個(gè)單細(xì)胞代謝過程的描繪。
對于這個(gè)結(jié)果，兩種新的基于PCR的方法已經(jīng)得到發(fā)展，保證了復(fù)雜環(huán)
境樣本中單細(xì)胞基因內(nèi)含物的分離。第一個(gè)技術(shù)是末端微流數(shù)字PCR配
合16S rDNA鑒定單個(gè)未被培養(yǎng)的細(xì)胞，并同時(shí)檢測這些細(xì)胞中的其他基
因。利用微流設(shè)備從復(fù)雜混合物中稀釋并分離細(xì)胞。這個(gè)分離步驟很關(guān)
鍵，分離出的細(xì)胞將分別作為多重復(fù)PCR反應(yīng)的模版。雖然到目前為止
，這項(xiàng)技術(shù)只被用于將研究特定代謝基因與木養(yǎng)白蟻后腸中一種細(xì)菌的
聯(lián)系，但原則上，它能夠應(yīng)用于任何基因與16S rDNA已鑒定的單細(xì)胞之
間。這項(xiàng)技術(shù)能分開獨(dú)立應(yīng)用于不同時(shí)期的細(xì)胞(在成熟，基因表達(dá)或
基因定位)研究中。而且，單細(xì)胞PCR的應(yīng)用避免了PCR人為誤差，例如
擴(kuò)增誤差和非設(shè)計(jì)性產(chǎn)物等。隨著白蟻后腸的研究，相似的微流技術(shù)已
用于人類牙齦縫隙中分離的微生物。在這項(xiàng)工作中，基因組從目標(biāo)個(gè)體
細(xì)胞擴(kuò)增，保證了它的基因擴(kuò)增大于1000。隨著單細(xì)胞基因組序列方法
的發(fā)展，未來會(huì)有更好的基因組技術(shù)出現(xiàn)。這項(xiàng)研究的有利之處在于它
能在復(fù)雜的菌群中鑒別出催化目標(biāo)反應(yīng)的微生物(例如，檢測特定功能
基因的出現(xiàn))。在這方面它與同位素陣列或SIP相似，對于微流數(shù)字PCR
技術(shù)細(xì)胞作為區(qū)別實(shí)體信息被保存。
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